Одной из наиболее острых проблем крупных предприятий является проблема неоднородности и неполной совместимости используемых программных систем. Скорее всего эти системы разрабатывались и внедрялись в разное время, различными поставщиками или собственными силами, для решения различных задач, на различных платформах, и плохо приспособлены для взаимного обмена информацией. Проблема разнородности информационных систем компании приводит к снижению эффективности их функционирования, увеличению затрат на поддержку и эксплуатацию, к периодическим потерям важной информации. Информационная инфраструктура бизнеса теряет эффективность, поэтому остро встает вопрос интеграции существующих программных систем в единое информационное пространство.

Компания "Система" предлагает услуги по интеграции приложений с использованием современных технологий и стандартов интеграции (BizTalk, Websphere, XML, SOAP, хранилища данных, ПО промежуточного уровня (middleware), сервера репликации, сервера транзакций).